بررسی ژنوم بیانشده در سلولهای غدد برگی گیاه دارویی Fruticosa Salvia برای تعیین عناصر مهم ژنومی
نویسندگان
چکیده مقاله:
سابقه و هدف : روش های ژنومیکس نظیر تجزیه و تحلیل توالی های EST، امکان شناسایی مارکرهای مرتبط با ژن های بیان شده و miRNA های شبکه های تنظیمی و متابولیکی را فراهم می آورند. در این مقاله شناسایی عناصر مرتبط با ژنوم بیان شده در غدد برگی Salvia fruticosaمورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش ها : 1465 توالی EST مربوط به کتابخانه ژنوم بیان شده در سلول غدد برگی گیاهان جنس Salvia از خانوادۀ نعناعیان از پایگاه داده NCBI دریافت شد. پس از جمع آوری و حذف توالی های مربوط به وکتور، کلروپلاست، توالی های تکراری، سر هم بندی آن ها، توالی های کانتیگ و سینگلتون ایجاد شد. با استفاده از جستجوی BlastX، hit های موجود و هم چنین فراوانی و توزیع نشانگرهای EST-SSR با استفاده از SSRTools مشخص شد. miRNA های مرتبط با توالی های مورد نظر با استفاده از مدل سازی و جستجو در گیاه آرابیدوپسیس مشخص شدند. یافته ها : تعداد 153 کانتیگ و 777 سینگلتون مشخص شد. BLASTX، 477unigene دارای hit را مشخص نمود. Gene enrichment analysis توالی ها را در گروه های کارکردی مختلف قرار داد. در بین نشانگرهای مولکولی EST-SSRs مشخص شده دی- نوکلئوتیدهای AT/GA ، تری- نوکلئوتیدهای GCC ، تترانوکلئوتیدهای TAAT دارای حداقل چهار تکرار بیش ترین فراوانی را دارد، برای تکرار های پنتا و هگزا نوکلئوتیدی AAGAG و AGTATT ، CGTGGT به صورت سه تکرار پشت سر هم یک بار گزارش شد. برای ژنوم بیان شده تعداد 40 عددmiRNA مرتبط با ژن های مختلف مشخص شد. نتیجه گیری : EST-SSRs مشخص شده در این گیاه می تواند برای تعیین تنوع بین گونه های مختلف این جنس در خانوادۀ گیاهان lamiaceae استفاده شود. دو miRNA مهم مرتبط برای تنظیم بیان ژن آنزیم مونوترپن سنتاز در مسیر تولید ترپنوئیدهای مهم موجود در این گیاه مورد استفاده قرار گیرد.
منابع مشابه
تعیین دماهای مهم جوانهزنی گیاه دارویی مروتلخ (Salvia mirzayanii) با استفاده از رگرسیون غیرخطی
ﺟﻮاﻧهزﻧﻲ بذر مهمترین عامل تعیینکنندۀ موفقیت یا شکست استقرار گیاه است و چنانچه رطوبت در حد مناسب باشد، آستانههای دمایی؛ تعیینکنندۀ سرعت و درصد نهایی جوانهزنی است. در نتیجه پیشبینی زمان و سرعت جوانهزنی در محدودۀ دمایی مناسب عامل تعیینکنندهای برای استقرار گیاه خواهد بود. این آزمایش با هدف ارزیابی مدلهای رگرسیونی برای برآورد دماهای مهم (کاردینال) بذر گیاه مروتلخ (Salvia mirzayanii) قالب ...
متن کاملمطالعه کشت بافت و اندامزایی در گیاه دارویی Salvia nemorosa
گیاه Salvia nemorosa از خانواده نعناعیان (Lamiaceae) است که دارای مصارف خوراکی، دارویی و زینتی میباشد. با توجه به عدم وجود اطلاعاتی در مورد کشت بافت این گیاه، کشت بافت و اندام S. nemorosa جهت ریزازدیادی آن بر روی محیط کشت مناسب صورت گرفت. کشت در شیشه این گیاه در محیط کشت MS با مقادیر مختلف هورمونی انجام شد. قطعات ریشه، محور زیر لپه، برگ و مریستم رأسی از دانهرستهای سترون رشد یافته در محیط کشت...
متن کاملاثر تنش خشکی بر تجمع ماده خشک، غلظت عناصر غذایی و قندهای محلول در گیاه دارویی مریمگلیلولهای (Salvia macrosiphon Boiss)
به منظور بررسی اثر تنش خشکی بر تجمع ماده خشک، غلظت برخی عناصر غذایی گیاه و همچنین میزان قند محلول گیاه دارویی Salvia macrosiphon Boiss ، آزمایشی در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار در گلخانه تحقیقاتی دانشگاه یزد در سال 1391 اجرا گردید. در این آزمایش، سطوح مختلف تنش خشکی (100، 75، 50 و 25 درصد ظرفیت زراعی) بر روی گیاه مورد نظر اعمال و صفات مورد نظر اندازهگیری گردید. نتایج آنالیز واریانس مشاهدا...
متن کاملبررسی فیتوشیمیایی اسانس گیاه دارویی Salvia eremophila Boiss. در مراحل مختلف فنولوژی در استان یزد
گیاه مریم گلی بیابانی با نام علمیBoiss. Salvia eremophila متعلق به تیره نعنا و یکی از گونه های معطر و انحصاری ایران است. این تحقیق با هدف مقایسه کمیت و کیفیت اسانس سرشاخههای این گیاه در مراحل مختلف فنولوژی در دو فصل بهار و تابستان در سال 1393 در منطقه حفاظت شده مرور از استان یزد انجام شد. مراحل فنولوژی مورد مطالعه شامل مرحله قبل از گلدهی، اوایل گلدهی، اواخر گلدهی و میوهدهی...
متن کاملAnti-Inflammatory and Antioxidant Activities of Salvia fruticosa: An HPLC Determination of Phenolic Contents
Objectives. Salvia fruticosa Mill. (S. fruticosa) is widely used in folk medicine. Accordingly, the present study was designed to evaluate the antioxidant and anti-inflammatory activities of S. fruticosa, and to determine the phenolic constituents of its extracts. Methods. The antioxidant activity was determined using 2,2-diphenylpicrylhydrazyl assay. Total phenolic contents were estimated usin...
متن کاملبررسی فیتوشیمیایی اسانس گیاه دارویی Salvia eremophila Boiss. در مراحل مختلف فنولوژی در استان یزد
گیاه مریم گلی بیابانی با نام علمیBoiss. Salvia eremophila متعلق به تیره نعنا و یکی از گونه های معطر و انحصاری ایران است. این تحقیق با هدف مقایسه کمیت و کیفیت اسانس سرشاخههای این گیاه در مراحل مختلف فنولوژی در دو فصل بهار و تابستان در سال 1393 در منطقه حفاظت شده مرور از استان یزد انجام شد. مراحل فنولوژی مورد مطالعه شامل مرحله قبل از گلدهی، اوایل گلدهی، اواخر گلدهی و میوهدهی...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 6 شماره None
صفحات 77- 86
تاریخ انتشار 2016-07
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023